Effectivement c'est un début de mycose ou d'attaque bactérienne. Très souvent on peine à discerner si la cause est due à un champignon où à une bactérie. Cela dit, si il s'agit d'une pathologie bactérienne les lésions ont très souvent une odeur nauséabonde, de décomposition. Alors que les mycoses dues à des champignons n'ont pas cette odeur.
Ce n'est pas encore trop étendu mais tu as raison de chercher à traiter pour éviter que cela se répande rapidement. En général en cas de problème dû à des champignons des crèmes telles que du Panalog, de la Fucidine et l'application régulière de Bétadine ou Vert de Malachite en parallèle parvient à traiter les cas les plus graves. C'est d'autant plus facile chez les tortues qui font une mue complète de la carapace comme les Trachemys. Le mieux serait de consulter un véto spécialisé pour qu'il te fournisse ces produits et contrôle que l'affection n'est pas bactérienne. Si c'est le cas il faut très souvent avoir recours aux antibiotiques par injection et en crème.
Nous avons des adresses de véto spé par département, n'hésite pas à nous communiquer le tien pour que nous puissions t'envoyer celles que nous avons par MP.
Il est plus prudent de séparer les tortues si une a un soucis, de toute façon avec des traitements de la carapace sous forme de gels, crèmes ou lotions il est conseillé de garder la tortue plutôt au sec et de renouveler l'eau tous les jours.